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另一边，随着三号机被确认为使徒，信息很快传递到了Nerv，而Nerv也快速的告诉了两名驾驶员，本来正准备着聚餐，以及期待着聚餐的两个人，在这一刻知道了事情，使徒来袭！
不得不说，Nerv的效率确实是非常高，他们以最快速度将两名驾驶者载到了基地，然后因为EVA零号机还处于破损维护状态，所以就只能够由EVA初号机出击，而这时，碇真嗣还并不知道这次来袭的使徒到底是什么，他只是在为聚餐被打扰而懊恼，接着，他看到了使徒从山的另一端走了过来。
“E，E，EVA！
？EVA三号机！
？”
碇真嗣看到这机体的第一时间就大声吼叫了出来，他陷入了震惊与心慌中，因为此刻的他已经不是动画里时的他了，一是性格的变化，二是他和明日香关系的变化，事实上，虽然没有言明，甚至他对凌波丽还有莫名的好感，但是这些日子里的那种奇特感觉，他和明日香的那种默契感，他也是感觉到了的，虽然没有言明，但是他已经在心里默认了和明日香的关系，他要守护她，无论如何都要！
然后等以后和平了，等以后和平了……他们的日子还会很长很长……
所以当罗杰说这次的EVA三号机很可能有问题时，他甚至不顾对父亲的惧怕感，当面就提出了疑问，甚至在检查之后依然坚持不让明日香试驾驶EVA三号机都是如此，而此刻，见到EVA三号机之后，他的心情简直难以形容，震惊，心慌，还有就是愤怒，极度的愤怒。
“爸爸！
你说过EVA三号机是没问题的！
你说了罗杰大叔只是在信口开河，你说了要让明日香试驾驶EVA三号机！
你都干了什么！
？”
在Nerv中，碇源堂只是双手抱拳的默然无语，他戴着的眼镜下面，冰冷的目光仿佛没有感情一样，只是冰冷的说道：“这是使徒，你可以攻击了。”
“攻击什么！
？你让我攻击明日香吗！
？可恶，可恶，可恶！
我是绝对不会攻击她的！”
碇真嗣大声吼叫着，疯狂的拍打着EVA驾驶舱里的座椅。
“那你会死的。”
碇源堂依然冷冷的说话道。
“死就死！
那怕是死，我也绝对不会攻击她，她，她……她是我要用生命去保护的人啊！”
碇真嗣依然大声吼叫道。
这时，EVA三号机已经来到了离EVA初号机大约千米的距离上，就见得EVA三号机猛的跳了起来，跳到了数百米的高度，然后猛的下落，直接砸在了EVA初号机身上，EVA初号机顿时被砸在了地上，而且直接被在地上砸出了一个大坑来。
EVA的驾驶与那些科幻系的机甲有很大的不同，其中最大的不同就在于EVA机体本身是一个生命体，巨大的人工生命体，而要驾驶这样巨大的人工生命体，那就必须要用人脑来代替EVA机体本身的大脑，也即是感同身受，只要EVA受到什么伤害，那么同样的伤害疼痛也会传递到驾驶员的大脑中，虽然身体看起来没有受到什么伤害，但实际上大脑已经收到了受伤的指令，而科学家们早就做过无数次此类实验了，大脑的功能强大到可以“欺骗”
身体，若是大脑身体真的受过如此重的伤，那么身体很可能就会真的如此的反应，严重时直接死亡都有可能。
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